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位於長崎第2大平原——深江田原的原之辻遺跡，是代表彌生時代至古墳時代初期（約2200年前至1650年前）繁榮的日本國內代表性彌生時代環濠集落遺址，獲指定為國家特別史蹟。中國史書《三國志》中的「魏志」倭人傳中，壹岐島就以一支國之姿登場，為彌生時代最尖端的交易據點，扮演重要的角色。
從原之辻遺跡出土的遺物有10萬項以上，其中1670項被指定為國家重要文化財產。原之辻遺跡中發現許多飄洋過海來到「一支國」的日本最古老的玻璃珠、裝在馬車上的青銅製零件、用於桿秤的青銅製秤錘、日本國內唯一的人面石以及在中國大陸及朝鮮半島製作的土器、使用的銅錢等許多描述著「與東亞的交流歷史」的資料。
笹塚古墳是在基壇上建築墳丘的2層式建築。基壇的部分為直徑70m、高3m，墳丘的部分為直徑40m、高10m。從笹塚古墳中發現了許多龜形裝飾用金屬，以及杏葉、雲珠、辻金具等金銅製馬具類。除了馬具之外，亦發現了新羅土器，能瞭解與朝鮮半島之間的關聯。出土的資料當中，有162項獲指定為國家重要文化財產。
雙六古墳中發現了在中國北齊製作的日本最古老的二彩陶器、在新羅製作的土器、在日本國內只發現2個的半圓形玻璃珠、亦曾在朝鮮半島發現的金銅製單鳳環頭大刀柄頭等，可見與中國大陸及朝鮮半島之間的關係很親密。出土的資料當中，有412項獲指定為國家重要文化財產。
豐臣秀吉在出兵朝鮮（文祿、慶長之役）時建築的要塞城，獲指定為國家史蹟。在位於壹岐島最北端的勝本浦的城山，以松浦鎮信（平戶）為中心，由有馬晴信（島原）、大村喜前（大村）、五島純玄（五島）等領主合力建築而成。勝本城是軍事基地，負責為前往朝鮮半島的士兵們補給糧食、修理武器等。
內海灣是造訪「一支國」王都——原之辻的古代船往來的玄關。於江戶時代末期的1861（文久元）年撰寫的《壹岐名勝圖誌》中，亦有描繪了內海灣模樣的插圖，記錄了源自散佈在海灣深處的村莊「深江村」的故事以及許多往來於內海灣的船隻。另外，灣內還存在著一座神秘的島，通往小島神社的道路只會在退潮時從海中浮現，在任何時代都是令人嚮往的地方。
透過文獻史料，我們得知壹岐島最高峰（212.8m）的山頂上，自古就設置了烽火台和瞭望番所，扮演重要的國防要衝角色。山頂上有海軍水路部於1889（明治22）年5月設置的「緯度測定標」。當時設置的緯度測定標當中，只有位於岳之辻的石標以及位於可從這裡遙望的馬渡島（佐賀縣唐津市）番所的辻石標等2處流傳至今，刻在石標上的設置年銘文證明岳之辻的石標是日本國內最古老的。
與原之辻遺跡共同在彌生時代（約2000年前）繁榮一時的環濠集落遺址。唐神遺跡不只是透過交易獲得各式各樣的鐵製品和鐵原材料、將鐵製品供給日本國內各地的中繼基地，更是相當於代表彌生時代的鐵器生產鍛冶工房的存在，可窺見其當時在東亞交易上扮演重要角色的情形。
16世紀中期，曾為松浦黨一份子的源壹建築的山城，以居城所在的山頂為中心，可以看見雙重無水護城壕及土橋。以生池城為居城的源壹深受朝鮮王朝信賴，留有正式交易的記錄。此外，1539（天文8）年在安國寺進行的「高麗版大般若經」修補紀錄中，亦記載了源壹的名字。
